La gouvernance de la Fondation est assurée par son Comité exécutif (Comex pour les intimes), il définit ses grandes orientations et sélectionne les projets.
Ses membres sont Alain Bernal (Sanofi) Didier Da Costa (Carrier), Olivier Artus UCLY), Céline de Laurens (Ville de Lyon), Didier Vinot (Lyon III), Georges Képénékian et Nicolas Gagneux (6ème sens Immobilier). Ils ont été depuis peu rejoints par Paul Castel. Ancien directeur d’établissements sanitaires et ancien directeur général de l’ARS PACA, Paul Castel participera à la sélection des projets issus de l’appel à projet 2021, en novembre prochain.